- 种子选取：选用抗病品种，做到抗源布局合理及品种定期轮换。陕西旱地可选用M8003、长武131；旱肥地可选用陕229、陕861；水地可选用陕927、陕160、西农88—1、水偃107、植81168；甘肃可选用天选40、天882、绵阳15、绵阳19、绵阳20；川育9号、川育10号；河北可选用冀麦19号、冀麦26号、冀麦5418、丰抗13号、京优626等；河南可选用豫麦17、郑8329、徐州21、郑891；长江下游可选用扬麦4号、5号。此外中国又育出了一大批抗条锈病新品种，各地可因地制宜选用。如京冬8号，京核3号（931），京411，冬麦1号，北农白，百农64，郑州8915、941，周麦9号一矮优688系，新宝丰；豫麦35、39，川麦24、25；绵阳25、26，川农麦1号，蜀万41号；冀审石4185，冀麦38、40、41、6021新系（9306）；皖麦26、27、28号，早麦5号，滇麦18号、19号、20号，渭麦8号，秦麦12号，西农1376号。春小麦有垦九5号，临麦29、30号，陇春15号，宁春24号，陇春9号，陇春8139，定丰3号，京红8号，科春14，青春26号、533号等。在应用抗病品种时，注意抗锈品种合理布局。利用抗病品种群体抗性多样化或异质性来控制锈菌群体组成的变化和优势小种形成。避免品种单一化，但也不能过多，并注意定期轮换，防止抗性丧失。
- 农业防治：适期播种，适当晚播，不要过早，可减轻秋苗期条锈病发生。清除自生麦。提倡施用酵素菌沤制的堆肥或腐熟有机肥，增施磷钾肥，搞好氮磷钾合理搭配，增强小麦抗病力。速效氮不宜过多、过迟，防止小麦贪青晚熟，加重受害。合理灌溉，土壤湿度大或雨后注意开沟排水，后期发病重的需适当灌水，减少产量损失。
- 药剂防治：药剂防治在缺少抗病品种或原有抗病品种抗锈性丧失，又无接班品种的麦区，需要进行药剂防治。我国先后使用对锈病有效的杀菌剂有敌钠酸、敌锈钠、氟钡制剂、氨基磺酸钙、氟硅脲、萎锈灵、灭菌丹、代森锌等。药剂拌种用种子重量0.03%（有效成分）三唑酮，即用25%三唑酮可湿性粉剂15g拌麦种150kg或12.5%特谱唑可湿性粉剂60～80g拌麦种50kg。春季叶面喷雾小麦拔节至孕穗期病叶普遍率达2%～4%，严重度达1%时开始喷洒20%三唑酮乳油或12.5%特谱唑（烯唑醇、速保利）可湿性粉剂1000～2000倍液、25%敌力脱（丙环唑）乳油2000倍液，做到普治与挑治相结合。小麦锈病、叶枯病、纹枯病混发时，于发病初期，667m^2用12．5%特谱唑可湿性粉剂20～35g，对水50～80L喷施效果优异，既防治锈病，又可兼治叶枯病和纹枯病。
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